La colaboración entre los Agentes del SINAI es un concepto que de forma recurrente aparece en la Ley Foral de Ciencia y Tecnología.
Se hace referencia a la Colaboración entre Agentes como herramienta fundamental en términos de: impulso, consolidación, mejora de competencias y competitividad, especialización, excelencia, búsqueda de la Internacionalización del Sistema y gestión del talento.